Whole-Genome Characterization of Epidemic Neisseria meningitidis Serogroup C and Resurgence of Serogroup W, Niger, 2015

Kretz, Cecilia B. ; Retchless, Adam C. ; et al.

In: Emerging Infectious Diseases, Jg. 22 (2016), Heft 10, S. 1762-1768

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In 2015, Niger reported the largest epidemic of Neisseria meningitidis serogroup C (NmC) meningitis in sub-Saharan Africa. The NmC epidemic coincided with serogroup W (NmW) cases during the epidemic season, resulting in a total of 9,367 meningococcal cases through June 2015. To clarify the phylogenetic association, genetic evolution, and antibiotic determinants of the meningococcal strains in Niger, we sequenced the genomes of 102 isolates from this epidemic, comprising 81 NmC and 21 NmW isolates. The genomes of 82 isolates were completed, and all 102 were included in the analysis. All NmC isolates had sequence type 10217, which caused the outbreaks in Nigeria during 2013–2014 and for which a clonal complex has not yet been defined. The NmC isolates from Niger were substantially different from other NmC isolates collected globally. All NmW isolates belonged to clonal complex 11 and were closely related to the isolates causing recent outbreaks in Africa.

Titel:	Whole-Genome Characterization of Epidemic Neisseria meningitidis Serogroup C and Resurgence of Serogroup W, Niger, 2015
Autor/in / Beteiligte Person:	Kretz, Cecilia B. ; Retchless, Adam C. ; Sidikou, Fati ; Issaka, Bassira ; Ousmane, Sani ; Schwartz, Stephanie ; Tate, Ashley H. ; Pana, Assimawè ; Njanpop-Lafourcade, Berthe-Marie ; Nzeyimana, Innocent ; Ricardo Obama Nse ; Deghmane, Ala-Eddine ; Hong, Eva ; Ola Brønstad Brynildsrud ; Novak, Ryan T. ; Meyer, Sarah A. ; Odile Ouwe Missi Oukem-Boyer ; Ronveaux, Olivier ; Caugant, Dominique A. ; Taha, Muhamed-Kheir ; Wang, Xin
Link:	Zum Volltext https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/22/10/16-0468_article https://doaj.org/toc/1080-6040 https://doaj.org/toc/1080-6059 https://doaj.org/article/9174b0bf869b4cf594df357a6077571f https://doi.org/10.3201/eid2210.160468
Zeitschrift:	Emerging Infectious Diseases, Jg. 22 (2016), Heft 10, S. 1762-1768
Veröffentlichung:	Centers for Disease Control and Prevention, 2016
Medientyp:	academicJournal
ISSN:	1080-6040 (print) ; 1080-6059 (print)
DOI:	10.3201/eid2210.160468
Schlagwort:	Meningococcal meningitis Neisseria meningitidis serogroup C whole-genome sequencing Niger meningitis belt bacteria Medicine Infectious and parasitic diseases RC109-216
Sonstiges:	Nachgewiesen in: BASE Sprachen: English Collection: Directory of Open Access Journals: DOAJ Articles Document Type: article in journal/newspaper Language: English

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