Rapid emergence of extensively drug-resistant Shigella sonnei in France
In: ISSN: 2041-1723, 2023
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International audience ; Shigella sonnei, the main cause of bacillary dysentery in high-income countries,has become increasingly resistant to antibiotics. We monitored the anti-microbial susceptibility of 7121 S. sonnei isolates collected in France between2005 and 2021. We detected a dramatic increase in the proportion of isolatessimultaneously resistant to ciprofloxacin (CIP), third-generation cephalos-porins (3GCs) and azithromycin (AZM) from 2015. Our genomic analysis of164 such extensively drug-resistant (XDR) isolates identified 13 differentclusters within CIP-resistant sublineage 3.6.1, which was selected in South Asia∼15 years ago. AZM resistance was subsequently acquired, principally throughIncFII (pKSR100-like) plasmids. The last step in the development of theXDR phenotype involved various extended-spectrum beta-lactamase genes(blaCTX-M-3, blaCTX-M-15, blaCTX-M-27, blaCTX-M-55, and blaCTX-M-134) carried bydifferent plasmids (IncFII, IncI1, IncB/O/K/Z) or even integrated into thechromosome, and encoding resistance to 3GCs. This rapid emergence of XDRS. sonnei, including an international epidemic strain, is alarming, and goodlaboratory-based surveillance of shigellosis will be crucial for informeddecision-making and appropriate public health action.
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Rapid emergence of extensively drug-resistant Shigella sonnei in France
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| Autor/in / Beteiligte Person: | Lefèvre, Sophie ; Njamkepo, Elisabeth ; Feldman, Sarah ; Ruckly, Corinne ; Carle, Isabelle ; Lejay-Collin, Monique ; Fabre, Laëtitia ; Yassine, Iman ; Frézal, Lise ; Pardos de la Gandara, Maria ; Fontanet, Arnaud ; Weill, François-Xavier ; Bactéries pathogènes entériques (BPE) ; Institut Pasteur Paris (IP)-Université Paris Cité (UPCité) ; Centre National de Référence - National Reference Center Escherichia coli, Shigella et Salmonella (CNR - laboratoire coordonnateur) ; Epidémiologie des Maladies Emergentes - Emerging Diseases Epidemiology ; Université Paris Cité (UPCité)-Pasteur-Cnam Risques infectieux et émergents (PACRI) ; Institut Pasteur Paris (IP)-Conservatoire National des Arts et Métiers CNAM (CNAM) ; HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut Pasteur Paris (IP)-Conservatoire National des Arts et Métiers CNAM (CNAM) ; HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM) ; Conservatoire National des Arts et Métiers CNAM (CNAM) ; HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM) ; This study was supported by the Institut Pasteur (F.-X.W. and A.F.), Santé publique France (F.-X.W.), and the French government’s Investissement d’Avenir program, Laboratoire d’Excellence ‘Integrative Biology ofEmerging Infectious Diseases’ (grant number ANR-10-LABX-62-IBEID) (F.-X.W.) ; ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010) |
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| Zeitschrift: | ISSN: 2041-1723, 2023 |
| Veröffentlichung: | HAL CCSD ; Nature Publishing Group, 2023 |
| Medientyp: | academicJournal |
| DOI: | 10.1038/s41467-023-36222-8 |
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