Additional file 1 of Assessing Bos taurus introgression in the UOA Bos indicus assembly

Maulana M. Naji (10116421) ; Yuri T. Utsunomiya (10116424) ; et al.

2021

unknown

Additional file 1: Table S1. Accession numbers and alignment details. The table provides the accession numbers of all individuals used as representatives of B. taurus and B. indicus, as well as details for alignments against both reference genomes (ARS_UCD1.2 and UOA_Brahman_1).

Titel:	Additional file 1 of Assessing Bos taurus introgression in the UOA Bos indicus assembly
Autor/in / Beteiligte Person:	Maulana M. Naji (10116421) ; Yuri T. Utsunomiya (10116424) ; Johann Sölkner (10116427) ; Benjamin D. Rosen (10116430) ; Gábor Mészáros (10116433)
Link:	https://figshare.com/articles/dataset/Additional_file_1_of_Assessing_Bos_taurus_introgression_in_the_UOA_Bos_indicus_assembly/17284391 https://doi.org/10.6084/m9.figshare.17284391.v1
Veröffentlichung:	2021
Medientyp:	unknown
DOI:	10.6084/m9.figshare.17284391.v1
Schlagwort:	Genetics reference allele bias produced within species multiple reference genomes low mapping accuracy increased mutation rate genes located within g . signatures interesting genomic features uoa_brahman_1 revealed regions taurus introgression represents single reference individual brahman cow haplotype complementary genome assembly uoa_brahman_1 reference genome uoa_brahman_1 assembly hereford cow genomic data brahman cattle uoa_brahman_1 detected variant calling taurus individuals taurus cattle taurus ) sequencing decreases sequence data scientific community region support principal component
Sonstiges:	Nachgewiesen in: BASE Sprachen: unknown Collection: Smithsonian Institution: Digital Repository Document Type: dataset Language: unknown Rights: CC BY + CC0

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