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The Agrobacterium tumefaciens nopaline strain 82.139 induces non-teratogenic shooty tumours on several plant species. We have determined the position of the T-region oncogenes in a 11.4 kb Xba I fragment which shows a general organization similar to its pTiC58 counterpart. Sequence analysis of the 4.7 kb right part of this fragment allowed us to identify the pTi82.139 ipt, 6b and nos coding sequences. pTi82.139 lacks the 6a gene, which lies between the ipt and 6b genes in pTiC58. The intervening region between the 6b and the nos genes contains an additional ORF with homology to ORF 21 (transcript 3') from the TR-DNA of octopine strain pTi15955.

Titel:	Oncogene arrangement in a shooty strain of Agrobacterium tumefaciens.
Autor/in / Beteiligte Person:	Drevet, C ; Brasileiro, AC ; Jouanin, L
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Zeitschrift:	Plant molecular biology, Jg. 25 (1994-04-01), Heft 1, S. 83-90
Veröffentlichung:	Dordrecht : Kluwer Academic ; <i>Original Publication</i>: The Hague ; Boston : Martinus Nijhoff/Dr. W. Junk, 1981-, 1994
Medientyp:	academicJournal
ISSN:	0167-4412 (print)
DOI:	10.1007/BF00024200
Schlagwort:	Base Sequence Cloning, Molecular Deoxyribonucleases, Type II Site-Specific Molecular Sequence Data Nucleic Acid Hybridization Open Reading Frames Phylogeny Restriction Mapping Agrobacterium tumefaciens genetics DNA, Bacterial chemistry Oncogenes Plasmids
Sonstiges:	Nachgewiesen in: MEDLINE Sprachen: English Publication Type: Journal Article; Research Support, Non-U.S. Gov't Language: English [Plant Mol Biol] 1994 Apr; Vol. 25 (1), pp. 83-90. MeSH Terms: Oncogenes* ; Plasmids* ; Agrobacterium tumefaciens / genetics ; DNA, Bacterial / chemistry ; Base Sequence ; Cloning, Molecular ; Deoxyribonucleases, Type II Site-Specific ; Molecular Sequence Data ; Nucleic Acid Hybridization ; Open Reading Frames ; Phylogeny ; Restriction Mapping References: Plant Cell. 1990 Mar;2(3):215-24. (PMID: 2152113) ; Cell. 1983 Apr;32(4):1045-56. (PMID: 6301679) ; EMBO J. 1991 Dec;10(13):3983-91. (PMID: 1756712) ; Plant Mol Biol. 1992 May;19(1):15-38. (PMID: 1600167) ; Plant Physiol. 1982 Feb;69(2):389-92. (PMID: 16662215) ; Plasmid. 1980 Mar;3(2):193-211. (PMID: 6100893) ; Mol Gen Genet. 1990 Aug;223(1):1-10. (PMID: 2259331) ; Mol Gen Genet. 1989 Apr;216(2-3):428-38. (PMID: 2546041) ; Nucleic Acids Res. 1983 Jan 25;11(2):369-85. (PMID: 6298724) ; Nucleic Acids Res. 1984 Jun 11;12(11):4665-77. (PMID: 6330678) ; Plant Mol Biol. 1991 Sep;17(3):441-52. (PMID: 1653060) ; J Bacteriol. 1984 Oct;160(1):327-32. (PMID: 6090422) ; Plant Mol Biol. 1983 Nov;2(6):335-50. (PMID: 24318453) ; EMBO J. 1984 Dec 20;3(13):3043-7. (PMID: 16453586) ; J Mol Appl Genet. 1982;1(6):561-73. (PMID: 7153689) ; Plant Mol Biol. 1988 Nov;11(6):731-44. (PMID: 24272624) ; Plasmid. 1978 Feb;1(2):238-53. (PMID: 748949) ; EMBO J. 1984 Jan;3(1):141-6. (PMID: 16453491) ; Mol Gen Genet. 1989 Oct;219(1-2):209-16. (PMID: 2615760) ; Mol Gen Genet. 1989 Jan;215(2):294-9. (PMID: 2651882) ; Nucleic Acids Res. 1987 Aug 25;15(16):6643-53. (PMID: 3628002) ; Plant Mol Biol. 1989 Jan;12(1):75-85. (PMID: 24272719) ; EMBO J. 1987 Nov;6(11):3203-8. (PMID: 16453801) ; Mol Gen Genet. 1992 Nov;235(2-3):292-303. (PMID: 1465104) ; Appl Environ Microbiol. 1990 Nov;56(11):3537-45. (PMID: 16348358) ; EMBO J. 1984 Apr;3(4):835-46. (PMID: 6327292) ; Plant Mol Biol. 1986 Jan;7(1):33-41. (PMID: 24302155) ; EMBO J. 1989 Dec 20;8(13):4197-204. (PMID: 2591372) ; EMBO J. 1986 Jun;5(6):1137-42. (PMID: 15966101) Molecular Sequence: GENBANK X56185; X74123 Substance Nomenclature: 0 (DNA, Bacterial) ; 0 (T-DNA) ; EC 3.1.21.- (endodeoxyribonuclease XBAI) ; EC 3.1.21.4 (Deoxyribonucleases, Type II Site-Specific) Entry Date(s): Date Created: 19940401 Date Completed: 19940718 Latest Revision: 20190821 Update Code: 20231215

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Oncogene arrangement in a shooty strain of Agrobacterium tumefaciens.