TMG-chitotriomycin as a probe for the prediction of substrate specificity of β-N-acetylhexosaminidases.

Shiota, H ; Kanzaki, H ; et al.

In: Carbohydrate research, Jg. 375 (2013-06-28), S. 29

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TMG-chitotriomycin (1) produced by the actinomycete Streptomyces annulatus NBRC13369 was examined as a probe for the prediction of substrate specificity of β-N-acetylhexosaminidases (HexNAcases). According to the results of inhibition assays, 14 GH20 HexNAcases from various organisms were divided into 1-sensitive and 1-insensitive enzymes. Three representatives of each group were investigated for their substrate specificity. The 1-sensitive HexNAcases hydrolyzed N-acetylchitooligosaccharides but not N-glycan-type oligosaccharides, whereas the 1-insensitive enzymes hydrolyzed N-glycan-type oligosaccharides but not N-acetylchitooligosaccharides, indicating that TMG-chitotriomycin can be used as a molecular probe to distinguish between chitin-degrading HexNAcases and glycoconjugate-processing HexNAcases.

Titel:	TMG-chitotriomycin as a probe for the prediction of substrate specificity of β-N-acetylhexosaminidases.
Autor/in / Beteiligte Person:	Shiota, H ; Kanzaki, H ; Hatanaka, T ; Nitoda, T
Link:	Zum Volltext
Zeitschrift:	Carbohydrate research, Jg. 375 (2013-06-28), S. 29
Veröffentlichung:	Amsterdam : Elsevier ; <i>Original Publication</i>: Amsterdam., 2013
Medientyp:	academicJournal
ISSN:	1873-426X (electronic)
DOI:	10.1016/j.carres.2013.04.024
Schlagwort:	Carbohydrate Conformation Dose-Response Relationship, Drug Enzyme Inhibitors chemistry Molecular Probes chemistry Structure-Activity Relationship Substrate Specificity drug effects Sugar Alcohols chemistry beta-N-Acetylhexosaminidases isolation & purification beta-N-Acetylhexosaminidases metabolism Enzyme Inhibitors pharmacology Molecular Probes pharmacology Sugar Alcohols pharmacology beta-N-Acetylhexosaminidases antagonists & inhibitors
Sonstiges:	Nachgewiesen in: MEDLINE Sprachen: English Publication Type: Journal Article; Research Support, Non-U.S. Gov't Language: English [Carbohydr Res] 2013 Jun 28; Vol. 375, pp. 29-34. <i>Date of Electronic Publication: </i>2013 Apr 27. MeSH Terms: Enzyme Inhibitors / pharmacology ; Molecular Probes / pharmacology ; Sugar Alcohols / pharmacology ; beta-N-Acetylhexosaminidases / antagonists & inhibitors ; Carbohydrate Conformation ; Dose-Response Relationship, Drug ; Enzyme Inhibitors / chemistry ; Molecular Probes / chemistry ; Structure-Activity Relationship ; Substrate Specificity / drug effects ; Sugar Alcohols / chemistry ; beta-N-Acetylhexosaminidases / isolation & purification ; beta-N-Acetylhexosaminidases / metabolism Substance Nomenclature: 0 (Enzyme Inhibitors) ; 0 (Molecular Probes) ; 0 (Sugar Alcohols) ; 0 (TMG-chitotriomycin) ; EC 3.2.1.52 (beta-N-Acetylhexosaminidases) Entry Date(s): Date Created: 20130521 Date Completed: 20140117 Latest Revision: 20130610 Update Code: 20240513

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