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    Extended Metadynamics Protocol for Binding/Unbinding Free Energies of Peptide Ligands to Class A G-Protein-Coupled Receptors.
    Calderón, JC ; Plut, E ; et al.
    In: Journal of chemical information and modeling, Jg. 64 (2024-01-08), Heft 1, S. 205-218
    Online academicJournal
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    A Computational Physics-based Approach to Predict Unbound Brain-to-Plasma Partition Coefficient, K <subscript>p,uu</subscript> .
    Lawrenz, M ; Svensson, M ; et al.
    In: Journal of chemical information and modeling, Jg. 63 (2023-06-26), Heft 12, S. 3786-3798
    Online academicJournal
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    Unbreaking Assemblies in Molecular Simulations with Periodic Boundaries.
    Bruininks, BMH ; Wassenaar, TA ; et al.
    In: Journal of chemical information and modeling, Jg. 63 (2023-06-12), Heft 11, S. 3448-3452
    Online academicJournal
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    Predicting Protein-Ligand Binding and Unbinding Kinetics with Biased MD Simulations and Coarse-Graining of Dynamics: Current State and Challenges.
    Wolf, S
    In: Journal of chemical information and modeling, Jg. 63 (2023-05-22), Heft 10, S. 2902-2910
    Online academicJournal
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    Unbinding Kinetics of Muscarinic M3 Receptor Antagonists Explained by Metadynamics Simulations.
    Galvani, F ; Pala, D ; et al.
    In: Journal of chemical information and modeling, Jg. 63 (2023-05-08), Heft 9, S. 2842-2856
    Online academicJournal
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    Binding and Unbinding Pathways of Peptide Substrates on the SARS-CoV-2 3CL Protease.
    Moritsugu, K ; Ekimoto, T ; et al.
    In: Journal of chemical information and modeling, Jg. 63 (2023-01-09), Heft 1, S. 240-250
    Online academicJournal
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    Ligand Unbinding Pathway and Mechanism Analysis Assisted by Machine Learning and Graph Methods.
    Bray, S ; Tänzel, V ; et al.
    In: Journal of chemical information and modeling, Jg. 62 (2022-10-10), Heft 19, S. 4591-4604
    Online academicJournal
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    Dynamic Docking of Macrocycles in Bound and Unbound Protein Structures with DynaDock.
    Meixner, M ; Zachmann, M ; et al.
    In: Journal of chemical information and modeling, Jg. 62 (2022-07-25), Heft 14, S. 3426-3441
    Online academicJournal
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    Baseline Model for Predicting Protein-Ligand Unbinding Kinetics through Machine Learning.
    Amangeldiuly, N ; Karlov, D ; et al.
    In: Journal of chemical information and modeling, Jg. 60 (2020-12-28), Heft 12, S. 5946-5956
    Online academicJournal
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    Comparing Fingerprints for Ligand-Based Virtual Screening: A Fast and Scalable Approach for Unbiased Evaluation.
    Martin, LJ ; Bowen, MT
    In: Journal of chemical information and modeling, Jg. 60 (2020-10-26), Heft 10, S. 4536-4545
    Online academicJournal
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    A Supervised Molecular Dynamics Approach to Unbiased Ligand-Protein Unbinding.
    Deganutti, G ; Moro, S ; et al.
    In: Journal of chemical information and modeling, Jg. 60 (2020-03-23), Heft 3, S. 1804-1817
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    LIT-PCBA: An Unbiased Data Set for Machine Learning and Virtual Screening.
    Tran-Nguyen, VK ; Jacquemard, C ; et al.
    In: Journal of chemical information and modeling, Jg. 60 (2020-09-28), Heft 9, S. 4263-4273
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    Residence Time Prediction of Type 1 and 2 Kinase Inhibitors from Unbinding Simulations.
    Braka, A ; Garnier, N ; et al.
    In: Journal of chemical information and modeling, Jg. 60 (2020-01-27), Heft 1, S. 342-348
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    Estimation of Protein-Ligand Unbinding Kinetics Using Non-Equilibrium Targeted Molecular Dynamics Simulations.
    Wolf, S ; Amaral, M ; et al.
    In: Journal of chemical information and modeling, Jg. 59 (2019-12-23), Heft 12, S. 5135-5147
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    Unraveling the Unbinding Pathways of Products Formed in Catalytic Reactions Involved in SIRT1-3: A Random Acceleration Molecular Dynamics Simulation Study.
    Muvva, C ; Murugan, NA ; et al.
    In: Journal of chemical information and modeling, Jg. 59 (2019-10-28), Heft 10, S. 4100-4115
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    Enhanced Sampling Simulations of Ligand Unbinding Kinetics Controlled by Protein Conformational Changes.
    Zhou, Y ; Zou, R ; et al.
    In: Journal of chemical information and modeling, Jg. 59 (2019-09-23), Heft 9, S. 3910-3918
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    Computational Model To Predict the Fraction of Unbound Drug in the Brain.
    Esaki, T ; Ohashi, R ; et al.
    In: Journal of chemical information and modeling, Jg. 59 (2019-07-22), Heft 7, S. 3251-3261
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    Predicting Residence Time and Drug Unbinding Pathway through Scaled Molecular Dynamics.
    Schuetz, DA ; Bernetti, M ; et al.
    In: Journal of chemical information and modeling, Jg. 59 (2019-01-28), Heft 1, S. 535-549
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    Maximal Unbiased Benchmarking Data Sets for Human Chemokine Receptors and Comparative Analysis.
    Xia, J ; Reid, TE ; et al.
    In: Journal of chemical information and modeling, Jg. 58 (2018-05-29), Heft 5, S. 1104-1120
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    Partner-Specific Prediction of Protein-Dimer Stability from Unbound Structure of Monomer.
    Hadi-Alijanvand, H ; Rouhani, M
    In: Journal of chemical information and modeling, Jg. 58 (2018-03-26), Heft 3, S. 733-745
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